В конце XIX века Кишиневский железнодорожный вокзал считался самым важным зданием города, поскольку самым быстрым и важным транспортом в то время была железная дорога.

Железнодорожный вокзал был построен в 1870-х годах. По некоторым данным, вначале было построено временное деревянное здание.

Новое здание вокзала было построено в конце 1870-х годов по архитектурному проекту Генриха Лонского.

Существуют различные сведения о том, когда на станцию прибыл первый поезд. Одни утверждают, что это произошло 15 августа 1871 года, другие историки считают, что 28 августа того же года. На самом деле это может быть одна и та же дата, но по новому или старому стилю. Важно то, что это событие произошло в августе 1871 года, и первый поезд действительно прибыл из Одессы. С этого момента и начинается история железных дорог Бессарабии того времени.

Здание вокзала построено по прямоугольному плану, стены облицованы кирпичом для фасадов. Центральный фасад здания имеет большой проем с полукруглой аркой — нишей, которая опирается на тройную арку главного входа.

29 июля 2004 года на привокзальной площади были установлены два уникальных памятника — https://visit.chisinau.md/en/obiective_turistice/monumentul-in-memoria-victimelor-deportarilor-regimului-comunist-sau-trenul-durerii/

а под мостом рядом со станцией был установлен старинный локомотив (серийный номер 1469), который когда-то осуществлял сообщение между Унгенами и деревней Корнешты и работал на этом маршруте до 1969 года. Локомотив был изготовлен в Польше, в городе Познань. Его реставрация заняла два месяца. Сейчас он служит экспонатом под открытым небом.

Здание вокзала пострадало в 1941 году и, после частичного восстановления оно было полностью разрушено  бомбардировками уже в 1944 году.

В 1948 году вокзал был восстановлен по проекту архитекторов А. Щусева и Л. Цюприна. Для строительства был использован камень, а для отделки — кирпич. Среди прилегающих построек можно отметить трамвайный павильон, возведенный рядом со зданием вокзала в 1976 году. Новая реконструкция вокзала началась 30 июля 2003 года. В это время была перестроена крыша над павильонами отправления.