Из исторических источников мы узнаем, что строительство церкви «Святого Георгия» началось в 1814 году, в историческом центре Кишинева, с благословения митрополита Гавриила Бэнулеску-Бодони.
Работы начались под руководством священника Георге, которому помогали его болгарские соотечественники. Одним из архитекторов святыни был архимандрит Иоанникий, гость из Санкт-Петербурга. Основная нагрузка легла на плечи Костина Ставараки.
Он был назначен настоятелем церкви, где и прослужил до 1830 года. Строительство было завершено около 1818 года, а 3 ноября она была освящена Епископом Бендерским и Аккерманским Думитру, викарием Кишинёва. Официальным годом завершения строительства считается 1819, когда был установлен иконостас.
В межвоенное время богослужения проводились на румынском и русском языках.
Летом 1940 года, после разрушительного землетрясения, церковь была серьезно разрушена. Необходимо было приложить определенные усилия для восстановления святого места.
В 1959 году церковь была закрыта. В 1978 году здание было объявлено памятником архитектуры, охраняемым государством, после чего была проведена реставрация.
В период национального возрождения церковь была возвращена прихожанам.